КОЭВОЛЮЦИЯ ГЕНОВ ТЕРМОРЕЦЕПТОРОВ СЕМЕЙСТВА TRP В 15 ПОПУЛЯЦИЯХ АЛТАЕ-САЯНСКОГО РЕГИОНА, ЗАПАДНОЙ СИБИРИ И ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Проведен анализ гена терморецептора TRPV3 (rs322937) в 15 популяционных выборках (1407 человек), относящихся к различным языковым группам и проживающих в регионах Алтае-Саянского нагорья, Западной Сибири, Дальнего Востока и Канады. Самая высокая частота редкого аллеля выявлена у якутов (42.9%), а низкая – у эскимосов (10.7%) и эвенков (10.8%). Отклонение от равновесия Харди–Вайнберга выявлено в популяции сибирских татар. Наибольшие межпопуляционные различия выявлены между якутами и эвенками, а наименьшие – между казахами, телегитами и хакасами, телегиттами и татарами, хакасами и нанайцами, тувинцами и северными алтайцами. Проведена трансассоциация полиморфных локусов генов TRPV1, TRPA1, TRPM8 и TRPV3 с помощью метода регрессионного анализа. Из шести пар генов в трех была выявлена положительная корреляция: TRPA1/TRPV3, TRPV3/TRPV1 и TRPV1/TRPM8. Изученный нами ген TRPV3 положительно скоррелирован с TRPV1 и TRPA1 и отрицательно с TRPM8. Полученные результаты могут свидетельствовать о различном селективном давлении в разных географических областях, определяемых климатическими факторами.

Об авторах

М. А Губина

Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук

Email: marina@bionet.nsc.ru
Новосибирск, Россия

В. Н Бабенко

Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук

Новосибирск, Россия

А. Ю Губина

Новосибирский государственный медицинский университет

Новосибирск, Россия

Список литературы

  1. Clapham D.E. TRP channels as cellular sensors // Nature. 2003. V. 426. P. 517–552. https://doi.org/10.1038/nature02196
  2. Clapham D.E., Julius D., Montell C., Schultz G. International union of pharmacology. XLIX. Nomenclature and structure-function relationships of transient receptor potential channels // Pharmacol. Rev. 2005. V. 57. № 4. P. 427–450. https://doi.org/10.1124/pr.57.4
  3. Mulier M., Vriens J., Voets T. TRP channel pores and local calcium signals // Cell Calcium. 2017. V. 66. P. 19–24. doi.org/10.1016/j.ceca.2017.04.007
  4. Smani T., Shapovalov G., Skryma R. et al. Functional and physiopathological implications of TRP channels // Biochim. Biophys. Acta. 2015. V. 1853. P. 1772–1782. https://doi.org/10.1016/j.bbamcr.2015.04.016
  5. Nilius B., Owsianik G., Voets T., Peters J. Transient receptor potential cation channels in disease // Physiol. Rev. 2007. V. 7. P. 165–217. https://doi.org/10.1152/physrev.00021.2006
  6. Caterina M.J., Schumacher M.A., Tominaga M. et al. The capsaicin receptor: A heat-activated ion channel in the pain pathway // Nature. 1997. V. 389. P. 816–824. https://doi.org/10.1038/39807
  7. Liu B., Qin F. Single-residue molecular switch for high-temperature dependence of vanilloid receptor TRPV3 // Proc. Natl Acad Sci. USA. 2017. V. 114. P. 1589–1594. https://doi.org/10.1073/pnas.1615304114
  8. Peier A.M., Reeve A.J., Andersson D.A. et al. A heat-sensitive TRP channel expressed in keratinocytes // Science. 2002. V. 296. P. 2046–2049. https://doi.org/10.1126/science.1073140
  9. Xu H., Ramsey I.S., Kotecha S.A. et al. TRPV3 is a calcium-permeable temperature-sensitive cation channel // Nature. 2002. V. 418. P. 181–186. https://doi.org/10.1038/nature00882
  10. Smith G.D., Gunthorpe M.J., Kelsell R.E. et al. TRPV3 is a temperature-sensitive vanilloid receptor-like protein // Nature. 2002. V. 418. P. 186–190. https://doi.org/10.1038/nature00894
  11. McKemy D.D., Neuhausser W.M., Julius D.D. Identification of a cold receptor reveals a general role for TRP channels in thermosensation // Nature. 2002. V. 416. P. 52–58. https://doi.org/10.1038/nature719
  12. Peier A.M., Moqrich A., Hergarden A.C. et al. A TRP channel that senses cold stimuli and menthol // Cell. 2002. V. 108. P. 705–715. https://doi.org/10.1016/s0092-8674(02)00652-9
  13. Story G.M., Peier A.M., Reeve A.J. et al. ANKTM1, a TRP-like channel expressed in nociceptive neurons, is activated by cold temperatures // Cell. 2003. V. 112. P. 819–829. https://doi.org/10.1016/s0092-8674(03)00158-2
  14. Губина М.А., Орлов П.С., Бабенко В.Н. и др. Полиморфизм генов терморецепторов TRPV1 и TRPA1 человека в популяциях Алтае-Саянского региона и Дальнего Востока // Генетика. 2018. Т. 54. № 2. С. 243–252.
  15. Губина М.А., Бабенко В.Н., Губина Е.Ю. Исследование полиморфного варианта гена холодового рецептора TRPM8 (rs7593557) в 15 популяциях Алтае-Саянского региона, Западной Сибири и Дальнего Востока // Генетика. 2024. Т. 60. № 8. С. 74–81.
  16. Ruhlen M.A. Guide to the World’s Languages. Classification. London, UK: Edward Arnold, 1991. 495 p.
  17. Greenberg J. Indo-European and its Closest Elatives: The Еurasiatic Family: Grammar. Stanford, CA: Stanford Univ. Рress, 2000. 345 p.
  18. Maniatis T., Fritsch E.E., Sambrook J. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. N.Y.: Cold Spring Harbor Lab., 1982. 545 p.
  19. Excoffier L., Lischer H.E. Arlequin suite ver. 3.5: А new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows // Mol. Ecol. Res. 2010. V. 10. P. 564–567. https://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2010.02847.x
  20. XLSTAT | Statistical Software for Excel – http://xlstat.com
  21. The 1000 Genomes Project Consortium. A global reference for human genetic variation // Nature. 2015. V. 526. P. 68–74. https://doi.org/10.1038/nature15393

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).