Спектр вариантов последовательности гена TP53 у хронически облученных людей

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Известно, что ионизирующее излучение способно повреждать генетический аппарат клетки не только за счет прямого воздействия, но и посредством индукции оксидативного стресса. Так, в результате окисления азотистого основания гуанина (G) продуктами оксидативного стресса могут возникать трансверсии типа G:C>T:A и G:C>С:G в гене-супрессоре опухолевого роста ТР53. В свою очередь, соматические и наследуемые варианты гена TP53 имеют большое значение в развитии злокачественных новообразований. В связи с этим, целью исследования явился анализ трансверсий G:C>T:A и G:C>С:G гена TP53 в клетках периферической крови, лиц, подвергшихся хроническому низкоинтенсивному радиационному воздействию. Представлены результаты анализа спектра вариантов последовательности гена TP53 на основе трансверсий G:C>T:A и G:C>С:G в клетках периферической крови у жителей прибрежных сел реки Течи Челябинской и Курганской областей, которые в 1950-х годах подверглись хроническому низкоинтенсивному радиационному воздействию. Диапазон индивидуальных значений накопленной поглощенной дозы облучения красного костного мозга за счет внешнего γ-излучения и ⁹⁰Sr составил от 2.1 до 2742.0 мГр (среднее значение – 605.4 ± 191.9 мГр (М ± SE)). В результате исследования у обследованных лиц в было выявлено семь различных вариантов гена TP53 на основе трансверсий G:C>T:A и G:C>С:G, представляющих собой однонуклеотидные замены. Все обнаруженные варианты присутствовали в базе данных IARC TP53 Database и не имели клинического значения как «патогенные» или «вероятно патогенные». Различия частот носителей обнаруженных вариантов гена TP53 между группой сравнения и основной группой не достигали статистически значимого уровня.

Полный текст

Клеточная ДНК постоянно окисляется в результате действия различных эндогенных и экзогенных агентов, в том числе и ионизирующего излучения, а возникающее в результате этого повреждения ДНК могут повышать риск развития рака и других заболеваний [1]. Гуанин имеет самый низкий окислительно-восстановительный потенциал из четырех оснований ДНК [2] и, следовательно, наиболее легко окисляется. Окисление гуанина в результате оксидативного стресса может приводить к трансверсиям. Как правило, 8-оксо-7,8-дигидрогуанин (8-oxoG), который является одним из наиболее распространенных окислительных повреждений ДНК, вызывает трансверсии G:C>T:A [3], в то время как 2,5-диаминоимидазол-4-он (Iz, 2,5-diamino-4H-imidazol-4-one), являющийся еще одним прямым продуктом окисления гуанина, способен вызывать трансверсии G:C>С:G [4-7].

Во время репликации ДНК включение аденина напротив продукта окисления гуанина вызывает трансверсию G:C>T:A, тогда как включение гуанина напротив продукта окисления гуанина вызывает трансверсию G:C>C:G. Эти мутации обнаружены во многих важных генах и, в частности, в сайтах CpG в гене – супрессоре опухоли ТР53 [8]. Кроме того, в результате репликации ДНК в стволовых клетках могут возникать нонсенс-мутации G:C>T:A, которые составляют до 60 % от всех нонсенс-мутаций в генах – супрессорах опухолей [9].

TP53 расположен на коротком плече хромосомы 17 (17p13). Он содержит 11 экзонов, охватывающих 20 тысяч оснований, и кодирует ядерный фосфопротеин массой 53 кДа. Первоначально он считался онкогеном, но генетические и функциональные данные, полученные через 10 лет после его открытия доказали, что он является супрессором опухоли. Инактивация функции TP53 или сопутствующих ему путей является общей чертой опухолей человека, которая часто коррелирует с повышенной злокачественностью, плохой выживаемостью пациентов и резистентностью к лечению [10].

Трансверсии G>Т могут быть вызваны действием различных канцерогенных факторов, в частности показаны замены G>Т в гене TP53 при раке легкого у курильщиков [11], при раке кожи, вызванном действием УФ-излучения [12]. В исследованиях на мышах, подвергшихся воздействию нейтронов и γ-излучения, наблюдалась положительная корреляция между числом переходов C:G>T:A и T:A>C:G и продолжительностью роста опухоли молочной железы. При этом в спектре мутаций замен одной пары оснований преобладали переходы C:G>T:A, и это было характерно как для спонтанных карцином молочной железы, так и для карцином, индуцированных нейтронами и γ-излучением [13].

В связи с этим целью исследования явился анализ трансверсий G:C>T:A и G:C>C:G гена TP53 в клетках периферической крови у лиц, подвергшихся хроническому низкоинтенсивному радиационному воздействию.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДИКА

Характеристика исследуемых групп

Секвенирование по Сэнгеру гена TP53 было проведено для 17 женщин из когорты р. Теча (КРТ) [14]. Использовались следующие критерии включения в исследуемые группы:

1) облученные лица из когорты р. Теча – проживавшие в одном из 41 сел, расположенных на побережье р. Теча, в период с 01.01.1950 по 31.12.1960 г.;
2) наличие рассчитанной индивидуальной поглощенной накопленной дозы облучения красного костного мозга (ККМ), тимуса и периферических лимфоидных органов.

Критерии исключения:

1) наличие у обследованных лиц онкологических, аутоиммунных, острых или хронических (период обострения) воспалительных заболеваний в течение последних трех месяцев.

Средний возраст всех женщин составил 71,0 ± 1.4 год (М ± SE), а возрастной диапазон: 58.0-82.0 лет. Возраст участников исследования указан на момент взятия образца крови. По этнической принадлежности наблюдалось следующее распределение: доля женщин славянского происхождения составила 53% (девять человек), представительниц тюркской языковой группы – 47% (восемь человек). Индивидуальные дозы облучения ККМ у женщин из основной группы составляли от 2.1 до 2742.0 мГр (среднее значение – 605.4 ± 191.9 мГр (М ± SE)). Индивидуальные накопленные дозы облучения тимуса и периферических лимфоидных органов находились в диапазоне от 0.8 до 197.3 мГр (среднее значение – 50.4 ± 13.7 мГр (М ± SE)) [14, 15].

Условное разделение на основную группу и группу внутреннего контроля (далее группа сравнения) представлено на рис. 1.

Рис. 1. Разделение обследованной выборки на группу сравнения и основную группу в зависимости от накопленной дозы облучения ККМ.

Fig. 1. Division of the examined sample into a comparison group and a main group depending on the accumulated radiation dose of the red bone marrow.

 

В основную группу вошли 10 женщин с накопленными дозами облучения ККМ от 135.8 до 2742.0 мГр (среднее значение – 1003.9 ± 261.5 мГр). В группу сравнения были включены семь женщин из КРТ, чьи дозы облучения ККМ не превышали 100 мГр (среднее значение накопленной поглощенной дозы в этой группе составило – 36,1 ± 9.7 мГр).

Выделение ДНК и секвенирование

Источником ДНК служили образцы цельной крови, которые хранились в биобанке лаборатории молекулярно-клеточной радиобиологии ФГБУН УНПЦ РМ ФМБА России при температуре –80°С. ДНК выделяли методом органической экстракции с помощью набора реагентов Extra Phen (ООО НПФ «АТГ-Биотех», Россия). Количество ДНК и чистоту образцов ДНК оценивали с помощью спектрофотометра NanoDrop 2000 (Thermo Scientific, США). Значения отношения А260/А280 находились в интервале 1.7–1.9. С помощью программы Primer DesignerTMTool (Thermo Scientific, США) были выбраны праймеры для ПЦР фрагментов ДНК, перекрывающих 2–11-й экзоны гена ТР53, и их секвенирования по Сэнгеру (табл. 1).

 

Таблица 1. Праймеры для ПЦР фрагментов ДНК, перекрывающих 2–11-й экзоны гена ТР53

Table 1. Primers for PCR of DNA fragments covering exons 2–11 of the TP53 gene

№

п/п

AB #

Последовательности праймеров (5′→3′)

№

амплификации

Длина,

п.н.

1

Hs00346583_CE

F: GGGACTGTAGATGGGTGAAAAGAG R: CTGTCTCAGACACTGGCATGGT

1

463

2

Hs00346582_CE

F: GAATCCCAAAGTTCCAAACAAAAGAA R: AGACTTCCTGAAAACAACGTTCTG

2

500

3

Hs00818498_CE

F: GAGAGATGCTGAGGGTGTGATG R: CTGGGCTTCTTGCATTCTGG

3

274

4

Hs00346581_CE

F: GTGAACAGATAAAGCAACTGGAAGAC R: ATCCCATCACACCCTCAGCATCT

4

511

5

Hs00346580_CE

F: CTCATAGGGCACCACCACACTA R: CTGAGGTGTAGACGCCAACTCT

5

517

6

Hs00424883_CE

F: GGGAGGCCCTTAGCCTCTGTAA R: TTTGCCAACTGGCCAAGACC

6

546

7

Hs00346578_CE

F: AAAGAGAAGCAAGAGGCAGTAAGG R: CTTGCCACAGGTCTCCCCAAG

7

497

8

Hs00346577_CE

F: TGTTGTTGGGCAGTGCTAGGA R: CATACTACTACCCATCCACCTCTC

8

494

9

Hs00494729_CE

F: CATCTGTATCAGGCAAAGTCATAGAAC R: CAGAGGAAGAGAATCTCCGCAAGAA

9

506

10

Hs00516544_CE

F: TAAAAGTAGGCTAGGCAGGCC R: AAGGACCAGACCAGCTTTCAA

10

531

11

Hs00439701_CE

F: GGCTGGGAGTTGCGGAGAAT R: GCAGTTTCTACTAAATGCATGTTGCTT

11

488

12

Hs00462018_CE

F: GGACAGCTTCCCTGGTTAGTACGG R: GGGTGTGGCCACCATCTTGA

12

566

13

Hs00454657_CE

F: CAAGTCTTGGTGGATCCAGATCAT R: CCACTGAACAAGTTGGCCTGC

13

578

14

Hs00346570_CE

F: TTCACCCCTCAGACACACAGGT R: TCCCACACCCTGGAGGATTTCAT

14

543

15

Hs00346569_CE

F: GGCTCAGCCTTGCTAAATCAGA R: CAGCTGGAAGGGTCAACATCTT

15

493

 

Состав ПЦР-смеси для амплификации и условия проведения реакции представлены в табл. 2. ПЦР проводили в амплификаторе C1000TMThermalCycler (Bio-Rad, США).

Наличие целевого продукта в ПЦР-смеси после проведения амплификации оценивали с помощью агарозного гель-электрофореза. С помощью набора ExoSAP-IT (Thermo Fishrer, USA) осуществлялась ферментативная очистка продуктов ПЦР.

 

Таблица 2. Состав ПЦР-смеси для амплификации соответствующих ампликонов

Table 2. Composition of the PCR mixture for amplification of the corresponding amplicons

№

ампли-

кона

Условия ПЦР (объем ПЦР-смеси 10 мкл)

Мастермикс

Объем*

10 мкмоль/л Frw

10 мкмоль/л Rev

GCen-hancer

dH20

ДНК**

Та***, °С

№1

360 MasterMix****

5

0.3

0.3

0.5

1.9

2

58

№3–11, 13–15

360 MasterMix

5

0.2

0.2

-

3.6

1

60

№2, 12

360 MasterMix

5

0.3

0.3

-

2.4

2

58

Примечание.

* Объемы выражены в мкл;
** образцы ДНК нормировали до концентрации 20 нг/мкл;
*** Та – температура отжига праймеров;
**** AmpliTaq GoldTM360 MasterMix – готовая смесь для ПЦР.

 

По завершении очистки проводили секвенирующую реакцию. На 5′-конце праймеров для ПЦР находился универсальный сайт прикрепления секвенирующих праймеров (М13). Олигонуклеотиды были синтезированы фирмой Invitrogen (США), последовательности: Forward – GTTGTAAAACGACGGCCAGTG, Reverse – AGCGGATAACAATTTCACACAGGA. Для секвенирования использовали BigDyeTM Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Thermo Fisher, США). Секвенирующие смеси очищали с помощью BigDyeXTerminatorTM Purification Kit (Applied Biosystems, США).

Статистический анализ

Сборку контиг, выравнивание последовательностей, сравнение с референтной последовательностью гена ТР53 (NG_017013.2) выполняли с помощью программы SeqScapev2.7 (Thermo Fisher, США). Биологическое значение детектированных вариантов анализировали с помощью базы данных IARC TP53 Database [16]. Значимость различий частоты встречаемости носителей вариантов секвенированной в нашем исследовании последовательности ТР53-гена между основной группой и группой сравнения оценивали с помощью точного теста Фишера. Уровень статистической значимости установили р < 0.05. Расчеты производили с помощью ПО Statistica V. 10.0.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

Секвенирование экзонных (2–11-й экзоны) и фланкирующих интронных регионов гена TP53 в образцах геномной ДНК всех обследованных женщин выявило семь различных вариантов, представляющих собой однонуклеотидные замены. Один вариант находился в кодирующем регионе: rs1042522 в обогащённом пролином домене. Шесть вариантов находились в некодирующей области гена: rs17879353 и rs199729221 в 3′НТО, а rs1642785, rs17883323, rs12947788 и rs77697176 представляли интронные варианты. Ни один из обнаруженных вариантов по данным ClinVar не имел клинического значения как «патогенный» или «вероятно патогенный» (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/). Все из обнаруженных нами вариантов присутствовали в базе данных IARC TP53 Database [16]. Обнаруженные варианты последовательности представлены в табл. 3.

 

Таблица 3. Описание обнаруженных вариантов гена ТР53 у обследованных женщин из КРТ

Table 3. Description of identified TP53 gene variants in the examined women of the Techa River cohort

№

Геномная ДНК

кДНК

RefSNP

Экзон/интрон

№ кодона

Тип замены

1

g.7676483G>C

c.74+38C>G

rs1642785

2-intron

0

Интронный вариант*

2

g.7676301G>T

c.97-29C>A

rs17883323

3-intron

0

Интронный вариант

3

g.7676154G>C

c.215C>G

rs1042522

4-exon

72

Миссенс**

4

g.7674109G>A

c.782+72C>T

rs12947788

7-intron

0

Интронный вариант

5

g.7673183G>A

c.993+352C>T

rs77697176

9-intron

0

Интронный вариант

6

g.7668996G>T

c.*613C>A

rs17879353

11-exon

0

3′ НТО***

7

g.7668855G>A

c.*754C>T

rs199729221

11-exon

0

3′ НТО

Примечание.

* Замена в области интрона;
** Миссенс вариант (с изменением аминокислотной последовательности);
*** 3′ – нетранслируемая область.

 

На сегодняшний день наиболее широко изучен несинонимичный полиморфизм в домене, богатом пролином, расположенном в экзоне 4, где замена цитозина на гуанин приводит к замене пролина (Pro) на аргинин (Arg) в кодоне 72 белка p53 (Arg72Pro, rs1042522). Эти два аллеля различаются по способности индуцировать транскрипцию гена-мишени, модулировать апоптоз с разной скоростью и взаимодействовать с белком p73 [17]. Вариант p53, имеющий полиморфный сайт и кодирующий аргинин (G), обладает более сильным апоптотическим потенциалом, в то время как вариант, кодирующий пролин (C), по-видимому, вызывает более высокий уровень задержки фазы G1 [18]. Частоты аллелей полиморфизма варьируются в разных популяциях и зависят от этнической принадлежности и географического положения. Так, в исследовании Dale L. Bodian et al. среди здоровых людей до 50 лет частота кодирующей аргинин (G) формы кодона 72 составляет 74.1% у европейцев и 37.2% у африканской субпопуляции [19]. В другом исследовании P.T. Diamantopoulos et al. сообщают, что среди больных хроническим лимфоцитарным лейкозом (медианный возраст пациентов составлял 70 лет) 98.6% обследованных имели полиморфный сайт, кодирующий аргинин (G) [20]. Однако данные о связи полиморфизма rs1042522 с риском развития злокачественных новообразований носят противоречивый характер и не дают однозначных ответов.

Согласно данным литературы, обнаруженные интронные варианты c.74+38C>G (rs1642785), c.782+72C>T (rs12947788) демонстрируют наличие связи с рисками развития злокачественных новообразований в ряде исследований [21–22], что вызывает споры о их клинической значимости. В свою очередь, полиморфизмы rs77697176 (c.993+352C>T), rs17883323 (c.97-29C>A), rs17879353 (c.*613C>A) и rs199729221 (c.*754C>T) не имеют достоверной ассоциации с заболеваниями, в частности, полиморфизм rs77697176 не вносит вклад в повышение риска развития колоректального рака [23].

Варианты последовательности гена TP53, обнаруженные для каждой обследованной женщины, представлены в табл. 4.

В табл. 5 представлены частоты встречаемости носителей вариантов гена TP53 в основной группе и группе сравнения.

 

Таблица 4. Наличие вариантов гена TP53 у обследованных женщин

Table 4. Presence of TP53 gene variants in the examined women

Группы

Замены

№ варианта*

1

2

3

4

5

6

7

Основная группа

8_135,8

G

C

G

C

C

C

C

9_212,0

G

C

G

C

C

C

C

10_301,1

G

C

G

C

C

M

C

11_459,4

S

C

S

C

C

C

T

12_749,5

G

C

G

C

C

C

T

13_1006,4

G

C

G

C

C

C

T

14_1092,0

C

C

C

C

C

C

T

15_1665,4

G

C

G

C

C

C

C

16_1675,2

S

C

S

C

C

C

C

17_2742,0

S

C

S

Y

C

C

C

Группа сравнения

1_2,1

G

C

G

C

Y****

C

T

2_26,2

G

C

G

C

Y

C

C

3_27,5

C

M***

C

Y

C

C

T

4_31,5

G

C

G

C

T

C

C

5_36,5

G

C

G

C

C

C

T

6_42,1

S**

M

S

C

C

C

C

7_86,7

G

C

G

C

C

C

T

Примечание.
* Номер варианта от 1 до 7 соответствует номеру варианта гена TP53, описанному в табл. 4. Описание обнаруженных вариантов гена ТР53 у обследованных женщин из КРТ. Подчеркнутые нуклеотиды – выявленная замена. Нуклеотидная последовательность приведена в соответствии с IUPAC кодировкой [Nomenclature Committee of the International Unionof Biochemistry (NC-IUB) (1986). Nomenclature for incompletely specified bases in nucleic acid sequences. Recommend];
** S – замена G или C;
*** М – замена А или C;
**** Y – замена C или Т.

 

Таблица 5. Частота встречаемости гомо- и гетерозиготных носителей вариантов гена ТР53 в основной группе и группе сравнения

Table 5. Frequency of occurrence of homo- and heterozygous carriers of TP53 gene variants in the main group and comparison group

 

RefSNP

MAF**, %

Основная группа (n = 10)

Группа сравнения (n = 7)

р

число

обследованных*

частота, 

%

число

обследованных

частота,

%

1

rs1642785

0.42

9

0.90

6

0.86

1.000

2

rs17883323

0.08

0

0.00

2

0.29

0.154

3

rs1042522

0.46

9

0.90

6

0.86

1.000

4

rs12947788

0.18

1

0.10

1

0.14

1.000

5

rs77697176

0.02

0

0.00

3

0.43

0.051

6

rs17879353

0.01

1

0.10

0

0.00

1.000

7

rs199729221

< 0.01

4

0.40

4

0.57

0.637

Примечание.
* Учитывались носители и гомозиготных, и гетерозиготных генотипов, содержащих вариантный аллель;
** усредненная частота минорного аллеля для европеоидных популяций (http://www.ensembl.org).

 

Как видно из данных, различия частот носителей обнаруженных вариантов гена TP53 между группой сравнения и основной группой не достигали статистически значимого уровня. Вариант последовательности rs77697176, находящийся в 9-м интроне, был выявлен у трех женщин из группы сравения и не встречался среди женщин из основной группы. Вероятность различия между группой сравнения и основной группой для этого варианта составила 0.051.

Однонуклеотидные замены могут иметь характерные паттерны, которые коррелируют с воздействием радиации. Так, описаны специфические мутационные сигнатуры, характерные для облучения [11, 13, 24]. Например, переходы C→T часто встречаются в ДНК облученных клеток и могут быть результатом дезаминирования цитозина под действием активных форм кислорода, образовавшихся в следствие воздействия ионизирующего излучения [24]. Такие специфические мутационные паттерны могут указывать на то, что ионизирующее излучение могло сыграть ключевую роль в их возникновении. Однако для точного ответа на вопрос, являются ли данные замены радиационно-индуцированными, требуется проведение дополнительных исследованием с изучением кровных родственников исследуемых лиц, а также оценки профиля мутаций в других биоматериалах участников исследования.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Таким образом, в результате анализа трансверсий G:C>T:A и G:C>C:G гена TP53 в клетках периферической крови у облученных лиц в отдаленные сроки после хронического радиационного воздействия было выявлено семь различных вариантов, представляющих собой однонуклеотидные замены. Ни один из обнаруженных вариантов не имел клинического значения как «патогенный» или «вероятно патогенный», а различия частот носителей обнаруженных вариантов гена TP53 между группой сравнения и основной группой не достигали статистически значимого уровня.

В дальнейшем будет проведено сравнительное исследование трансверсий G:C>T:A гена TP53 у облученных лиц, имеющих онкологические заболевания, с облученными лицами без таковых.

ФИНАНСИРОВАНИЕ

Исследование выполнено при финансовой поддержке Федерального медико-биологического агентства в рамках выполнения федеральной целевой программы «Обеспечение ядерной и радиационной безопасности на 2016–2020 годы и на период до 2030 года» (контракт № 27.501.21.2 от 11.06.2021 г).

ВКЛАД АВТОРОВ

В.С. Никифоров — планирование исследования, выполнение лабораторных методов исследования, написание статьи.

А.В. Кореченкова — статистическая обработка результатов, редакция текста статьи и подготовка окончательного варианта статьи.

А. В. Аклеев — редакция текста статьи и подготовка окончательного варианта статьи.

КОНФЛИКТ ИНТЕРЕСОВ

Авторы декларируют отсутствие явных и потенциальных конфликтов интересов, связанных с публикацией настоящей статьи.

ИНФОРМИРОВАННОЕ СОГЛАСИЕ НА УЧАСТИЕ В ИССЛЕДОВАНИИ

Все участники исследования до включения в исследование добровольно подписали форму информированного согласия, утвержденную в составе протокола исследования этическим комитетом ФГБУН УНПЦ РМ ФМБА России (протокол № 2 от 13 апреля 2023 г.).

×

Об авторах

Владислав Сергеевич Никифоров

Уральский научно-практический центр радиационной медицины ФМБА России; Челябинский государственный университет

Автор, ответственный за переписку.
Email: nikiforovx@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-6685-1823
Россия, Челябинск; Челябинск

Анастасия Витальевна Кореченкова

Уральский научно-практический центр радиационной медицины ФМБА России

Email: korechenkova@urcrm.ru
ORCID iD: 0009-0008-6588-3517
Россия, Челябинск

Александр Васильевич Аклеев

Уральский научно-практический центр радиационной медицины ФМБА России; Челябинский государственный университет

Email: akleyev@urcrm.ru
ORCID iD: 0000-0003-2583-5808
Россия, Челябинск; Челябинск

Список литературы

  1. Kasai H. What causes human cancer? Approaches from the chemistry of DNA damage. Genes Environ. 2016;38:19. https://doi.org/10.1186/s41021-016-0046-8
  2. Steenken S., Jovanovic S.V. How easily oxidizable is DNA? One-electron reduction potentials of adenosine and guanosine radicals in aqueous solution. J. Am. Chem. Soc. 1997;119(3):617–618. https://doi.org/10.1021/ja962255b
  3. Kino K., Hirao-Suzuki M., Morikawa M. et al. Generation, repair and replication of guanine oxidation products. Genes Environ. 2017;39:21. https://doi.org/10.1186/s41021-017-0081-0
  4. Kino K., Sugiyama H. Possible cause of G-C-->C-G transversion mutation by guanine oxidation product, imidazolone. Chem. Biol. 2001;8(4):369-378. https://doi.org/10.1016/s1074-5521(01)00019-9
  5. Jiang D., Rusling J.F. Oxidation Chemistry of DNA and p53 Tumor Suppressor Gene. Chem. Open. 2019;8(3):252-265. https://doi.org/10.1002/open.201800292
  6. Kino K., Sugiyama H. UVR-induced G-C to C-G transversions from oxidative DNA damage. Mutat. Res. 2005;571(1-2):33-42. https://doi.org/10.1016/j.mrfmmm.2004.10.010
  7. Ming X., Matter B., Song M. et al. Mapping structurally defined guanine oxidation products along DNA duplexes: influence of local sequence context and endogenous cytosine methylation. J. Am. Chem. Soc. 2014;136(11):4223-4235. https://doi.org/10.1021/ja411636j
  8. Khaled H.M., Bahnassi A.A., Zekri A.R. et al. Correlation between p53 mutations and HPV in bilharzial bladder cancer. Urol. Oncol. 2003;21(5):334-341. https://doi.org/10.1016/s1078-1439(03)00014-0
  9. Zhang M., Yang D., Gold B. Origins of nonsense mutations in human tumor suppressor genes. Mutat. Res. 2021;823:111761. https://doi.org/10.1016/j.mrfmmm.2021.111761
  10. Daver N.G., Maiti A., Kadia T.M. et al. TP53-Mutated Myelodysplastic Syndrome and Acute Myeloid Leukemia: Biology, Current Therapy, and Future Directions [published correction appears in Cancer Discov. 2022 Dec. 2;12(12):2954. https://doi.org/10.1158/2159-8290 CD-22-1192]. Cancer. Discov. 2022;12(11):2516-2529. https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-22-0332
  11. Pfeifer G.P., Denissenko M.F., Olivier M. et al. Tobacco smoke carcinogens, DNA damage and p53 mutations in smoking-associated cancers. Oncogene. 2002;21(48):7435-7451. https://doi.org/10.1038/sj.onc.1205803
  12. Dumaz N., Drougard C., Sarasin A., Daya-Grosjean L. Specific UV-induced mutation spectrum in the p53 gene of skin tumors from DNA-repair-deficient xeroderma pigmen-tosum patients. Proc. Nat. Acad. Sci. 1993;90(22):10529–1053. https://doi.org/10.1073/pnas.90.22.10529
  13. Moriyama H., Daino K., Ishikawa A. et al. Exome of Radiation-induced Rat Mammary Carcinoma Shows Copy-number Losses and Mutations in Human-relevant Cancer Genes. Anticancer Res. 2021;41(1):55-70. https://doi.org/10.21873/anticanres.14751
  14. Дегтева М.О., Напье Б.А., Толстых Е.И. и др. Распределение индивидуальных доз в когорте людей, облученных в результате радиоактивного загрязнения реки Течи. Мед. радиология и радиац. безопасность. 2019;64(3):46–53. [Degteva M.O., Napier B.A., Tolstykh E.I. et al. Individual Dose Distribution in Cohort of People Exposed as a Result of Radioactive Contamination of the Techa River. Medical Radiology and Radiation Safety. 2019;64(3):46-53. (In. Russ.)]. https://doi.org/10.12737/article_5cf2364cb49523.98590475
  15. Аклеев А.В., Варфоломеева Т.А., Блинова Е.А. и др. Возможности адаптации к малым дозам радиации. Челябинский государственный университет, Уральский научно-практический центр радиационной медицины ФМБА России. Санкт-Петербург: OOO «Изд-во «СпецЛит»; 2019. 111 с. ISBN 978-5299-01004-6. [Akleev A.V., Varfolomeeva T.A., Blinova E.A. i dr. Vozmozhnosti adaptacii k malym dozam radiacii = Possibilities of adaptation to low doses of radiation. Cheljabinskij gosudarstvennyj universitet, Ural’skij nauchno-prakticheskij centr radiacionnoj mediciny FMBA Rossii. Sankt-Peterburg: Obshhestvo s ogranichennoj otvetstvennost’ju “Izdatel’stvo “SpecLit”; 2019. 111 s. ISBN 978-5-299-01004-6. (In. Russ.)].
  16. Bouaoun L., Sonkin D., Ardin M. et al. TP53 Variations in Human Cancers: New Lessons from the IARC TP53 Database and Genomics Data. Hum. Mutat. 2016;37(9):865-876. https://doi.org/10.1002/humu.23035
  17. Dumont P., Leu J.I., Della Pietra A.C. 3rd. et al. The codon 72 polymorphic variants of p53 have markedly different apoptotic potential. Nat. Genet. 2003;33(3):357–365. https://doi.org/10.1038/ng1093
  18. Pim D., Banks L. p53 polymorphic variants at codon 72 exert different effects on cell cycle progression. Int. J. Cancer. 2004;108(2):196.199. https://doi.org/10.1002/ijc.11548
  19. Bodian D.L., McCutcheon J.N., Kothiyal P. et al. Germline variation in cancer-susceptibility genes in a healthy, ancestrally diverse cohort: implications for individual genome sequencing. PLoS One. 2014;9(4):e94554. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0094554
  20. Diamantopoulos P.T., Samara S., Kollia P. et al. Tumor Protein 53 Gene Mutations Without 17p13 Deletion Have No Significant Clinical Implications in Chronic Lymphocytic Leukemia. Detection of a New Mutation. Anticancer Res. 2017;37(5):2387–2391. https://doi.org/10.21873/anticanres.11577
  21. Jha P., Jha P., Pathak P. et al. TP53 polymorphisms in gliomas from Indian patients: Study of codon 72 genotype, rs1642785, rs1800370 and 16 base pair insertion in intron-3. Exp. Mol. Pathol. 2011;90(2):167–172. https://doi.org/10.1016/j.yexmp.2010.11.002
  22. Zhang G., Xu Q., Liu J. et al. Five P53 SNPs Involved in Low Rectal Cancer Risk and Prognosis in a Chinese Population. J. Cancer. 2019;10(7):1772–1780. https://doi.org/10.7150/jca.26722
  23. Škereňová M., Halašová E., Matáková T. et al. Low Variability and Stable Frequency of Common Haplotypes of the TP53 Gene Region in Colorectal Cancer Patients in a Slovak Population. Anticancer Res. 2017;37(4):1901–1907. https://doi.org/10.21873/anticanres.11528
  24. Lee C.L., Mowery Y.M., Daniel A.R. et al. Mutational landscape in genetically engineered, carcinogeninduced, and radiation-induced mouse sarcoma. JCI Insight. 2019;4(13):e128698. https://doi.org/10.1172/jci.insight.128698

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Разделение обследованной выборки на группу сравнения и основную группу в зависимости от накопленной дозы облучения ККМ.

Скачать (62KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).