Сравнительная оценка особенностей генетического разнообразия тюленей замкнутых водоемов

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Впервые проведена сравнительная оценка генетического разнообразия по нейтральным маркерам (15 микросателлитных локусов ядерной ДНК) двух видов тюленей замкнутых водоемов: байкальской (Pusa sibirica) и каспийской (P. caspica) нерп в сравнении с океаническим видом рода – кольчатой нерпой (P. hispida). Показано, что оба вида, населяющие замкнутые водоемы, характеризуются сниженным уровнем генетического разнообразия, наименьшим у байкальской нерпы. Как для байкальской, так и для каспийской нерпы показана высокая вероятность прохождения через бутылочное горлышко, в то время как для исследованной популяции кольчатой нерпы признаков резкого снижения численности в прошлом выявлено не было. Анализ полученных данных в пакете VarEff позволяет предположить разное время существования последнего общего предка для каждой из трех исследованных популяций; для байкальской нерпы это время оказывается существенно меньшим, чем для каспийской.

Об авторах

С. И. Мещерский

Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук

Email: sergeymeshcherskiy@gmail.com
Москва, Россия

И. Г. Мещерский

Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук

Москва, Россия

М. A. Соловьёва

Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук

Москва, Россия

Н. В. Крюкова

Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук

Москва, Россия

М.-Р. Д. Магомедов

Прикаспийский институт биологических ресурсов Дагестанского ФИЦ Российской академии наук

Махачкала, Россия

Ф. В. Климов

Казахстанское агентство прикладной экологии (ТОО “КАПЭ”)

Алма-Ата, Казахстан

В. В. Рожнов

Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук

Email: rozhnov-v-2015@yandex.ru
Москва, Россия

Список литературы

  1. Пастухов В.Д. Нерпа Байкала. Новосибирск: Наука. 1993. 272 с.
  2. Петров Е.А. Байкальская нерпа. Улан-Удэ: Экос. 2009. 176 с.
  3. Современное состояние биопродуктивности Каспийского моря и причины деградации популяции тюленя за последние 300 лет. Ред.: Сокольский А.Ф., Абдурахманов Г.М., Попова Н.В. и др. Астрахань: Полиграфком. 2008. 178 с.
  4. Sasaki H., Numachi K., Grachev A. The Origin and Genetic Relationships of the Baikal Seal, Phoca sibirica, by Restriction Analysis of Mitochondrial DNA // Zool. Sci. 2003. V. 20. P. 1417–1422.
  5. Goodman S.J., Clarke L., Jackson A., et al. Assessment of genetic variation, population structure and demographic history of Caspian seals (Pusa caspica) using microsatellites and mitochondrial sequence variation // Marine Mammals of the Holarctic. Collection of scientific papers after the 9th International Conference. Astrakhan, Russia. 31 October – 05 November, 2016. М.: Совет по морским млекопитающим. 2018. V. 1. P. 150–152. https://marmam.ru/upload/conf-documents/mmc2016_full.pdf
  6. Yakupova A., Tomarovsky A., Totikov A., et al. Chromosome-Length Assembly of the Baikal Seal (Pusa sibirica) Genome Reveals a Historically Large Population Prior to Isolation in Lake Baikal // Genes. 2023. 14: 619.
  7. Мещерский С.И., Мещерский И.Г., Соловьёва М.А., Рожнов В.В. Генетические особенности популяции байкальской нерпы (Pusa sibirica) // Доклады российской академии наук. Науки о жизни. 2023. Т. 511. № 1. С. 340–343.
  8. Palo J.U., Mäkinen H.S., Helle E., et al. Microsatellite variation in ringed seals (Phoca hispida): genetic structure and history of the Baltic Sea population // Heredity. 2001. V. 86. P. 609–617.
  9. Repenning C.A., Ray C.E., Gricorescu D. Pinniped biogeography // Gray J., Boucot A.J. (eds). Historical biogeography, plate tectonics, and the changing environment. OR, Corvallis: Oregon State Univ. Press. 1979. P. 357–369.
  10. Palo J.U., Väinölä R. The enigma of the landlocked Baikal and Caspian seals addressed through phylogeny of Phocine mitochondrial sequences // Biol. J. Linnean Society. 2006. V. 88. P. 61–72.
  11. Петров Е.А. Байкальская нерпа: эколого-эволюционные аспекты. Дис. докт. биол. наук. 03.00.16 – экология. Улан-Удэ, БГУ. 2003. 364 c.
  12. Fulton T.L., Strobeck C. Multiple markers and multiple individuals refine true seal phylogeny and bring molecules and morphology back in line // Proc. R. Soc. B. 2010. V. 277, P. 1065–1070.
  13. Nyakatura K., Bininda-Emonds O.R.P. Updating the evolutionary history of Carnivora (Mammalia): a new species-level supertree complete with divergence time estimates // BMC Biology. 2012. V. 10(1): 12.
  14. Davis C.S., Stirling I., Strobeck C., et al. Population structure of ice-breeding seals // Molecular Ecology. 2008. V.17. P. 3078–3094.
  15. Martinez-Bakker M.E., Sell S.K, Swanson B.J., et al. Combined Genetic and Telemetry Data Reveal High Rates of Gene Flow, Migration, and Long-Distance Dispersal Potential in Arctic Ringed Seals (Pusa hispida) // PLoS ONE. 2013. V. 8(10): e77125.
  16. Lang A.R., Boveng P., Quakenbush L., et al. Re-examination of population structure in Arctic ringed seals using DArTseq genotyping // Endangered species research. 2021. V. 44. P. 11–31.
  17. Löytynoja A., Rastas P., Valtonen, et al. Fragmented habitat compensates for the adverse effects of genetic bottleneck // Current Biology. 2023.V. 33. P. 1009–1018.
  18. Rosing-Asvid A., Löytynoja A., Momigliano P., et al. An evolutionarily distinct ringed seal in the Ilulissat Icefjord // Molecular Ecology. 2023. V. 32. P. 5932–5943.
  19. Крылов В.И. Особенности биологии каспийских тюленей южного Каспия // Морские млекопитающие. Тез. докл. IX Всес. совещ. по изучению, охране и рациональному использованию морских млекопитающих. Архангельск, 9–11 сент. 1986 г. Архангельск: АН СССР – ВНИРО, 1986. С. 220–221.
  20. Shirazi A.S., Qashqaei A.T., S. Faezi S., et al. First confirmed records of white-coat pups of the Endangered Caspian seal Pusa caspica on the coast of Iran // Oryx. 2023. V. 57. Is. 6. P. 784–787.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».